Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Higd1bQ99JY6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms