Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR6

Nmnat3, Nicotinamide/nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmnat3Q99JR6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nmnat3Q99JR6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nmnat3Q99JR6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nmnat3Q99JR6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nmnat3Q99JR6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nmnat3Q99JR6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nmnat3Q99JR6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nmnat3Q99JR6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nmnat3Q99JR6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nmnat3Q99JR6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nmnat3Q99JR6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nmnat3Q99JR6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nmnat3Q99JR6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nmnat3Q99JR6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nmnat3Q99JR6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nmnat3Q99JR6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nmnat3Q99JR6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nmnat3Q99JR6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nmnat3Q99JR6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nmnat3Q99JR6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nmnat3Q99JR6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nmnat3Q99JR6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nmnat3Q99JR6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nmnat3Q99JR6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nmnat3Q99JR6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nmnat3Q99JR6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nmnat3Q99JR6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nmnat3Q99JR6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nmnat3Q99JR6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nmnat3Q99JR6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nmnat3Q99JR6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nmnat3Q99JR6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nmnat3Q99JR6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nmnat3Q99JR6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nmnat3Q99JR6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms