Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH7

Clstn3, Calsyntenin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3Q99JH7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Clstn3Q99JH7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 229 ms