Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apobec3Q99J72 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Apobec3Q99J72 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Apobec3Q99J72 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apobec3Q99J72 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apobec3Q99J72 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apobec3Q99J72 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apobec3Q99J72 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apobec3Q99J72 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Apobec3Q99J72 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apobec3Q99J72 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apobec3Q99J72 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apobec3Q99J72 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apobec3Q99J72 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apobec3Q99J72 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apobec3Q99J72 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apobec3Q99J72 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apobec3Q99J72 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Apobec3Q99J72 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apobec3Q99J72 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apobec3Q99J72 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apobec3Q99J72 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apobec3Q99J72 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apobec3Q99J72 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apobec3Q99J72 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apobec3Q99J72 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apobec3Q99J72 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apobec3Q99J72 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apobec3Q99J72 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apobec3Q99J72 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Apobec3Q99J72 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apobec3Q99J72 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Apobec3Q99J72 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apobec3Q99J72 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apobec3Q99J72 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apobec3Q99J72 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apobec3Q99J72 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Apobec3Q99J72 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apobec3Q99J72 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apobec3Q99J72 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apobec3Q99J72 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apobec3Q99J72 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Apobec3Q99J72 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Apobec3Q99J72 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apobec3Q99J72 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apobec3Q99J72 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apobec3Q99J72 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apobec3Q99J72 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms