Protein–RNA interactions for Protein: Q925N1

Sfxn4, Sideroflexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn4Q925N1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sfxn4Q925N1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfxn4Q925N1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms