Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tubb6Q922F4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms