Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Snx18Q91ZR2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms