Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpe65Q91ZQ5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpe65Q91ZQ5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpe65Q91ZQ5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpe65Q91ZQ5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms