Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde6cQ91ZQ1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pde6cQ91ZQ1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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