Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atl3Q91YH5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atl3Q91YH5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Atl3Q91YH5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atl3Q91YH5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atl3Q91YH5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atl3Q91YH5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atl3Q91YH5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atl3Q91YH5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atl3Q91YH5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atl3Q91YH5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atl3Q91YH5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atl3Q91YH5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atl3Q91YH5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atl3Q91YH5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atl3Q91YH5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atl3Q91YH5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atl3Q91YH5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atl3Q91YH5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atl3Q91YH5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atl3Q91YH5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atl3Q91YH5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atl3Q91YH5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atl3Q91YH5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atl3Q91YH5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atl3Q91YH5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atl3Q91YH5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atl3Q91YH5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atl3Q91YH5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atl3Q91YH5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atl3Q91YH5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atl3Q91YH5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atl3Q91YH5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Atl3Q91YH5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atl3Q91YH5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atl3Q91YH5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atl3Q91YH5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atl3Q91YH5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atl3Q91YH5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atl3Q91YH5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atl3Q91YH5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atl3Q91YH5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atl3Q91YH5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atl3Q91YH5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atl3Q91YH5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atl3Q91YH5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atl3Q91YH5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Atl3Q91YH5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atl3Q91YH5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atl3Q91YH5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atl3Q91YH5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms