Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Trpm2Q91YD4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Trpm2Q91YD4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Trpm2Q91YD4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Trpm2Q91YD4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Trpm2Q91YD4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Trpm2Q91YD4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Trpm2Q91YD4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Trpm2Q91YD4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Trpm2Q91YD4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Trpm2Q91YD4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Trpm2Q91YD4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Trpm2Q91YD4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Trpm2Q91YD4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Trpm2Q91YD4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Trpm2Q91YD4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Trpm2Q91YD4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Trpm2Q91YD4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Trpm2Q91YD4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Trpm2Q91YD4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Trpm2Q91YD4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Trpm2Q91YD4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Trpm2Q91YD4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Trpm2Q91YD4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Trpm2Q91YD4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Trpm2Q91YD4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Trpm2Q91YD4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Trpm2Q91YD4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Trpm2Q91YD4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Trpm2Q91YD4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Trpm2Q91YD4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Trpm2Q91YD4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Trpm2Q91YD4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Trpm2Q91YD4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Trpm2Q91YD4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Trpm2Q91YD4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Trpm2Q91YD4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Trpm2Q91YD4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Trpm2Q91YD4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Trpm2Q91YD4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Trpm2Q91YD4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Trpm2Q91YD4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Trpm2Q91YD4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Trpm2Q91YD4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Trpm2Q91YD4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Trpm2Q91YD4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Trpm2Q91YD4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Trpm2Q91YD4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Trpm2Q91YD4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Trpm2Q91YD4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Trpm2Q91YD4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Trpm2Q91YD4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Trpm2Q91YD4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Trpm2Q91YD4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Trpm2Q91YD4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Trpm2Q91YD4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Trpm2Q91YD4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Trpm2Q91YD4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Trpm2Q91YD4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Trpm2Q91YD4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Trpm2Q91YD4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Trpm2Q91YD4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Trpm2Q91YD4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Trpm2Q91YD4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Trpm2Q91YD4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Trpm2Q91YD4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Trpm2Q91YD4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Trpm2Q91YD4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Trpm2Q91YD4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Trpm2Q91YD4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Trpm2Q91YD4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Trpm2Q91YD4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Trpm2Q91YD4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Trpm2Q91YD4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Trpm2Q91YD4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Trpm2Q91YD4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Trpm2Q91YD4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Trpm2Q91YD4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Trpm2Q91YD4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Trpm2Q91YD4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Trpm2Q91YD4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Trpm2Q91YD4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Trpm2Q91YD4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Trpm2Q91YD4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Trpm2Q91YD4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Trpm2Q91YD4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Trpm2Q91YD4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Trpm2Q91YD4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Trpm2Q91YD4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Trpm2Q91YD4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Trpm2Q91YD4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Trpm2Q91YD4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Trpm2Q91YD4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Trpm2Q91YD4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Trpm2Q91YD4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Trpm2Q91YD4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Trpm2Q91YD4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Trpm2Q91YD4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Trpm2Q91YD4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Trpm2Q91YD4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms