Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y17

Pcdha2, Protocadherin alpha 2, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha2Q91Y17 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha2Q91Y17 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha2Q91Y17 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha2Q91Y17 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha2Q91Y17 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha2Q91Y17 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha2Q91Y17 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha2Q91Y17 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha2Q91Y17 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha2Q91Y17 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha2Q91Y17 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha2Q91Y17 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha2Q91Y17 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha2Q91Y17 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha2Q91Y17 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha2Q91Y17 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha2Q91Y17 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha2Q91Y17 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha2Q91Y17 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha2Q91Y17 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha2Q91Y17 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdha2Q91Y17 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdha2Q91Y17 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdha2Q91Y17 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdha2Q91Y17 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pcdha2Q91Y17 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdha2Q91Y17 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdha2Q91Y17 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdha2Q91Y17 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdha2Q91Y17 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha2Q91Y17 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha2Q91Y17 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha2Q91Y17 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha2Q91Y17 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha2Q91Y17 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha2Q91Y17 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha2Q91Y17 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha2Q91Y17 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha2Q91Y17 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha2Q91Y17 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha2Q91Y17 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha2Q91Y17 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha2Q91Y17 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha2Q91Y17 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha2Q91Y17 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha2Q91Y17 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha2Q91Y17 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha2Q91Y17 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha2Q91Y17 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha2Q91Y17 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha2Q91Y17 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha2Q91Y17 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha2Q91Y17 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha2Q91Y17 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha2Q91Y17 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha2Q91Y17 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha2Q91Y17 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha2Q91Y17 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms