Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Basp1Q91XV3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Basp1Q91XV3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Basp1Q91XV3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Basp1Q91XV3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Basp1Q91XV3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Basp1Q91XV3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Basp1Q91XV3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Basp1Q91XV3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Basp1Q91XV3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Basp1Q91XV3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Basp1Q91XV3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Basp1Q91XV3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Basp1Q91XV3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Basp1Q91XV3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Basp1Q91XV3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Basp1Q91XV3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Basp1Q91XV3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Basp1Q91XV3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Basp1Q91XV3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Basp1Q91XV3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Basp1Q91XV3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Basp1Q91XV3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Basp1Q91XV3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Basp1Q91XV3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Basp1Q91XV3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Basp1Q91XV3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Basp1Q91XV3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Basp1Q91XV3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Basp1Q91XV3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Basp1Q91XV3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Basp1Q91XV3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Basp1Q91XV3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Basp1Q91XV3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Basp1Q91XV3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Basp1Q91XV3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Basp1Q91XV3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Basp1Q91XV3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Basp1Q91XV3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Basp1Q91XV3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Basp1Q91XV3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Basp1Q91XV3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Basp1Q91XV3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms