Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD6

Vps36, Vacuolar protein-sorting-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps36Q91XD6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vps36Q91XD6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vps36Q91XD6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps36Q91XD6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps36Q91XD6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps36Q91XD6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps36Q91XD6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps36Q91XD6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps36Q91XD6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps36Q91XD6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps36Q91XD6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps36Q91XD6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps36Q91XD6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps36Q91XD6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps36Q91XD6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps36Q91XD6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps36Q91XD6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps36Q91XD6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps36Q91XD6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps36Q91XD6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps36Q91XD6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps36Q91XD6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps36Q91XD6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps36Q91XD6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps36Q91XD6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps36Q91XD6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps36Q91XD6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps36Q91XD6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps36Q91XD6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps36Q91XD6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps36Q91XD6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps36Q91XD6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps36Q91XD6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps36Q91XD6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms