Protein–RNA interactions for Protein: Q91WU4

Tmco4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco4Q91WU4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmco4Q91WU4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmco4Q91WU4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmco4Q91WU4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmco4Q91WU4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmco4Q91WU4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmco4Q91WU4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmco4Q91WU4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmco4Q91WU4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmco4Q91WU4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmco4Q91WU4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmco4Q91WU4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmco4Q91WU4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmco4Q91WU4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmco4Q91WU4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmco4Q91WU4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmco4Q91WU4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmco4Q91WU4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmco4Q91WU4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmco4Q91WU4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmco4Q91WU4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmco4Q91WU4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmco4Q91WU4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmco4Q91WU4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmco4Q91WU4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmco4Q91WU4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmco4Q91WU4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmco4Q91WU4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmco4Q91WU4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmco4Q91WU4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmco4Q91WU4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmco4Q91WU4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms