Protein–RNA interactions for Protein: Q91WG3

Trub2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Trub2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub2Q91WG3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trub2Q91WG3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Trub2Q91WG3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trub2Q91WG3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trub2Q91WG3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trub2Q91WG3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trub2Q91WG3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trub2Q91WG3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trub2Q91WG3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trub2Q91WG3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trub2Q91WG3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trub2Q91WG3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trub2Q91WG3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trub2Q91WG3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trub2Q91WG3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Trub2Q91WG3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trub2Q91WG3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trub2Q91WG3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trub2Q91WG3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trub2Q91WG3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Trub2Q91WG3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trub2Q91WG3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trub2Q91WG3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trub2Q91WG3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trub2Q91WG3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Trub2Q91WG3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trub2Q91WG3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Trub2Q91WG3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trub2Q91WG3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trub2Q91WG3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trub2Q91WG3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trub2Q91WG3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trub2Q91WG3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trub2Q91WG3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trub2Q91WG3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trub2Q91WG3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trub2Q91WG3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trub2Q91WG3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trub2Q91WG3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trub2Q91WG3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trub2Q91WG3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trub2Q91WG3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms