Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Setd3Q91WC0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Setd3Q91WC0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Setd3Q91WC0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd3Q91WC0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd3Q91WC0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd3Q91WC0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd3Q91WC0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd3Q91WC0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Setd3Q91WC0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Setd3Q91WC0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Setd3Q91WC0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Setd3Q91WC0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Setd3Q91WC0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Setd3Q91WC0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Setd3Q91WC0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Setd3Q91WC0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Setd3Q91WC0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Setd3Q91WC0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Setd3Q91WC0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setd3Q91WC0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms