Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Csde1Q91W50 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Csde1Q91W50 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csde1Q91W50 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csde1Q91W50 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csde1Q91W50 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csde1Q91W50 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csde1Q91W50 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csde1Q91W50 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csde1Q91W50 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csde1Q91W50 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csde1Q91W50 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms