Protein–RNA interactions for Protein: Q91VU6

Dcaf11, DDB1- and CUL4-associated factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcaf11Q91VU6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dcaf11Q91VU6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dcaf11Q91VU6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Dcaf11Q91VU6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Dcaf11Q91VU6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Dcaf11Q91VU6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Dcaf11Q91VU6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Dcaf11Q91VU6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Dcaf11Q91VU6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Dcaf11Q91VU6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Dcaf11Q91VU6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Dcaf11Q91VU6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Dcaf11Q91VU6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Dcaf11Q91VU6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Dcaf11Q91VU6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Dcaf11Q91VU6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Dcaf11Q91VU6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Dcaf11Q91VU6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Dcaf11Q91VU6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Dcaf11Q91VU6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Dcaf11Q91VU6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Dcaf11Q91VU6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Dcaf11Q91VU6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Dcaf11Q91VU6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Dcaf11Q91VU6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Dcaf11Q91VU6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Dcaf11Q91VU6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Dcaf11Q91VU6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Dcaf11Q91VU6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Dcaf11Q91VU6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Dcaf11Q91VU6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Dcaf11Q91VU6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Dcaf11Q91VU6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Dcaf11Q91VU6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dcaf11Q91VU6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dcaf11Q91VU6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dcaf11Q91VU6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dcaf11Q91VU6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dcaf11Q91VU6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dcaf11Q91VU6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Dcaf11Q91VU6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Dcaf11Q91VU6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Dcaf11Q91VU6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Dcaf11Q91VU6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Dcaf11Q91VU6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Dcaf11Q91VU6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Dcaf11Q91VU6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Dcaf11Q91VU6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Dcaf11Q91VU6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Dcaf11Q91VU6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Dcaf11Q91VU6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Dcaf11Q91VU6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Dcaf11Q91VU6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Dcaf11Q91VU6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Dcaf11Q91VU6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Dcaf11Q91VU6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Dcaf11Q91VU6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Dcaf11Q91VU6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Dcaf11Q91VU6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Dcaf11Q91VU6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Dcaf11Q91VU6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Dcaf11Q91VU6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Dcaf11Q91VU6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Dcaf11Q91VU6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Dcaf11Q91VU6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Dcaf11Q91VU6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Dcaf11Q91VU6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Dcaf11Q91VU6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Dcaf11Q91VU6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Dcaf11Q91VU6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Dcaf11Q91VU6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Dcaf11Q91VU6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Dcaf11Q91VU6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Dcaf11Q91VU6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Dcaf11Q91VU6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Dcaf11Q91VU6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Dcaf11Q91VU6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Dcaf11Q91VU6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Dcaf11Q91VU6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Dcaf11Q91VU6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Dcaf11Q91VU6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Dcaf11Q91VU6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Dcaf11Q91VU6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Dcaf11Q91VU6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Dcaf11Q91VU6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Dcaf11Q91VU6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Dcaf11Q91VU6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Dcaf11Q91VU6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Dcaf11Q91VU6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Dcaf11Q91VU6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Dcaf11Q91VU6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Dcaf11Q91VU6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Dcaf11Q91VU6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Dcaf11Q91VU6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Dcaf11Q91VU6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Dcaf11Q91VU6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Dcaf11Q91VU6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Dcaf11Q91VU6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Dcaf11Q91VU6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Dcaf11Q91VU6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms