Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW4

Cacng5, Voltage-dependent calcium channel gamma-5 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng5Q8VHW4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacng5Q8VHW4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacng5Q8VHW4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms