Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps4aQ8VEJ9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms