Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc71Q8VEG0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc71Q8VEG0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc71Q8VEG0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc71Q8VEG0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc71Q8VEG0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc71Q8VEG0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc71Q8VEG0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc71Q8VEG0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc71Q8VEG0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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