Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc115Q8VE99 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms