Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stx18Q8VDS8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stx18Q8VDS8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stx18Q8VDS8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stx18Q8VDS8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stx18Q8VDS8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stx18Q8VDS8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stx18Q8VDS8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx18Q8VDS8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx18Q8VDS8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx18Q8VDS8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx18Q8VDS8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx18Q8VDS8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx18Q8VDS8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx18Q8VDS8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx18Q8VDS8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx18Q8VDS8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx18Q8VDS8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx18Q8VDS8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx18Q8VDS8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx18Q8VDS8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx18Q8VDS8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx18Q8VDS8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx18Q8VDS8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Stx18Q8VDS8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx18Q8VDS8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx18Q8VDS8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx18Q8VDS8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx18Q8VDS8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx18Q8VDS8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx18Q8VDS8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx18Q8VDS8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx18Q8VDS8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx18Q8VDS8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx18Q8VDS8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx18Q8VDS8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx18Q8VDS8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx18Q8VDS8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx18Q8VDS8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx18Q8VDS8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx18Q8VDS8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx18Q8VDS8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx18Q8VDS8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx18Q8VDS8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx18Q8VDS8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx18Q8VDS8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx18Q8VDS8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx18Q8VDS8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms