Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS3

Cbx7, Chromobox protein homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx7Q8VDS3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cbx7Q8VDS3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms