Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDM4

Psmd2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd2Q8VDM4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmd2Q8VDM4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmd2Q8VDM4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmd2Q8VDM4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmd2Q8VDM4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmd2Q8VDM4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psmd2Q8VDM4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Psmd2Q8VDM4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psmd2Q8VDM4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Psmd2Q8VDM4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psmd2Q8VDM4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psmd2Q8VDM4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmd2Q8VDM4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmd2Q8VDM4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmd2Q8VDM4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmd2Q8VDM4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmd2Q8VDM4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmd2Q8VDM4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmd2Q8VDM4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmd2Q8VDM4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmd2Q8VDM4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmd2Q8VDM4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmd2Q8VDM4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmd2Q8VDM4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd2Q8VDM4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd2Q8VDM4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd2Q8VDM4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd2Q8VDM4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd2Q8VDM4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmd2Q8VDM4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd2Q8VDM4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd2Q8VDM4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd2Q8VDM4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd2Q8VDM4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd2Q8VDM4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd2Q8VDM4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd2Q8VDM4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd2Q8VDM4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd2Q8VDM4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmd2Q8VDM4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmd2Q8VDM4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmd2Q8VDM4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmd2Q8VDM4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmd2Q8VDM4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmd2Q8VDM4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmd2Q8VDM4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmd2Q8VDM4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmd2Q8VDM4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd2Q8VDM4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd2Q8VDM4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd2Q8VDM4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd2Q8VDM4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd2Q8VDM4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd2Q8VDM4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd2Q8VDM4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms