Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt25Q8VCW2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt25Q8VCW2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt25Q8VCW2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt25Q8VCW2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt25Q8VCW2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt25Q8VCW2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt25Q8VCW2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt25Q8VCW2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt25Q8VCW2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt25Q8VCW2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt25Q8VCW2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt25Q8VCW2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt25Q8VCW2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt25Q8VCW2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt25Q8VCW2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt25Q8VCW2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt25Q8VCW2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt25Q8VCW2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt25Q8VCW2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt25Q8VCW2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt25Q8VCW2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt25Q8VCW2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt25Q8VCW2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt25Q8VCW2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt25Q8VCW2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt25Q8VCW2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt25Q8VCW2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt25Q8VCW2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt25Q8VCW2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt25Q8VCW2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt25Q8VCW2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt25Q8VCW2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Krt25Q8VCW2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Krt25Q8VCW2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt25Q8VCW2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt25Q8VCW2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt25Q8VCW2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt25Q8VCW2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt25Q8VCW2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt25Q8VCW2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt25Q8VCW2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt25Q8VCW2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt25Q8VCW2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt25Q8VCW2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt25Q8VCW2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt25Q8VCW2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt25Q8VCW2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt25Q8VCW2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt25Q8VCW2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt25Q8VCW2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt25Q8VCW2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt25Q8VCW2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt25Q8VCW2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt25Q8VCW2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt25Q8VCW2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.7 ms