Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ubxn4Q8VCH8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ubxn4Q8VCH8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ubxn4Q8VCH8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn4Q8VCH8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn4Q8VCH8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn4Q8VCH8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn4Q8VCH8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn4Q8VCH8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ubxn4Q8VCH8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ubxn4Q8VCH8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn4Q8VCH8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn4Q8VCH8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn4Q8VCH8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn4Q8VCH8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn4Q8VCH8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn4Q8VCH8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn4Q8VCH8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubxn4Q8VCH8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubxn4Q8VCH8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn4Q8VCH8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn4Q8VCH8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn4Q8VCH8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn4Q8VCH8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn4Q8VCH8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn4Q8VCH8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn4Q8VCH8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn4Q8VCH8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn4Q8VCH8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ubxn4Q8VCH8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ubxn4Q8VCH8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ubxn4Q8VCH8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ubxn4Q8VCH8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ubxn4Q8VCH8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ubxn4Q8VCH8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ubxn4Q8VCH8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms