Protein–RNA interactions for Protein: Q8R5K2

Usp33, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 33, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp33Q8R5K2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp33Q8R5K2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp33Q8R5K2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp33Q8R5K2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp33Q8R5K2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp33Q8R5K2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp33Q8R5K2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp33Q8R5K2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp33Q8R5K2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp33Q8R5K2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp33Q8R5K2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp33Q8R5K2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp33Q8R5K2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp33Q8R5K2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp33Q8R5K2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp33Q8R5K2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp33Q8R5K2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp33Q8R5K2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp33Q8R5K2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp33Q8R5K2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp33Q8R5K2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp33Q8R5K2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp33Q8R5K2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp33Q8R5K2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp33Q8R5K2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp33Q8R5K2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp33Q8R5K2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp33Q8R5K2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp33Q8R5K2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp33Q8R5K2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp33Q8R5K2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp33Q8R5K2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp33Q8R5K2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp33Q8R5K2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp33Q8R5K2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp33Q8R5K2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp33Q8R5K2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp33Q8R5K2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp33Q8R5K2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp33Q8R5K2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp33Q8R5K2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp33Q8R5K2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp33Q8R5K2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp33Q8R5K2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp33Q8R5K2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp33Q8R5K2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp33Q8R5K2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp33Q8R5K2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp33Q8R5K2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp33Q8R5K2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp33Q8R5K2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp33Q8R5K2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp33Q8R5K2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp33Q8R5K2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp33Q8R5K2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp33Q8R5K2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms