Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Top1mtQ8R4U6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Top1mtQ8R4U6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Top1mtQ8R4U6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Top1mtQ8R4U6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Top1mtQ8R4U6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Top1mtQ8R4U6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Top1mtQ8R4U6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Top1mtQ8R4U6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Top1mtQ8R4U6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Top1mtQ8R4U6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Top1mtQ8R4U6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Top1mtQ8R4U6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Top1mtQ8R4U6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Top1mtQ8R4U6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Top1mtQ8R4U6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Top1mtQ8R4U6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Top1mtQ8R4U6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Top1mtQ8R4U6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Top1mtQ8R4U6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Top1mtQ8R4U6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Top1mtQ8R4U6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Top1mtQ8R4U6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top1mtQ8R4U6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top1mtQ8R4U6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top1mtQ8R4U6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top1mtQ8R4U6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Top1mtQ8R4U6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Top1mtQ8R4U6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms