Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K9

E2f4, Transcription factor E2F4, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f4Q8R0K9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2f4Q8R0K9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2f4Q8R0K9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2f4Q8R0K9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2f4Q8R0K9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2f4Q8R0K9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2f4Q8R0K9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2f4Q8R0K9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
E2f4Q8R0K9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2f4Q8R0K9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2f4Q8R0K9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2f4Q8R0K9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2f4Q8R0K9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms