Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0H9

Gga1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga1Q8R0H9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gga1Q8R0H9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gga1Q8R0H9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gga1Q8R0H9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gga1Q8R0H9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gga1Q8R0H9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gga1Q8R0H9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gga1Q8R0H9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gga1Q8R0H9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gga1Q8R0H9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gga1Q8R0H9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gga1Q8R0H9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gga1Q8R0H9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gga1Q8R0H9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gga1Q8R0H9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gga1Q8R0H9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gga1Q8R0H9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gga1Q8R0H9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gga1Q8R0H9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gga1Q8R0H9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gga1Q8R0H9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gga1Q8R0H9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gga1Q8R0H9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gga1Q8R0H9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gga1Q8R0H9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gga1Q8R0H9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gga1Q8R0H9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gga1Q8R0H9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gga1Q8R0H9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gga1Q8R0H9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gga1Q8R0H9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gga1Q8R0H9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gga1Q8R0H9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gga1Q8R0H9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gga1Q8R0H9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gga1Q8R0H9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gga1Q8R0H9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms