Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5C0

Grhl2, Grainyhead-like protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grhl2Q8K5C0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grhl2Q8K5C0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grhl2Q8K5C0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grhl2Q8K5C0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grhl2Q8K5C0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grhl2Q8K5C0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grhl2Q8K5C0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grhl2Q8K5C0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grhl2Q8K5C0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grhl2Q8K5C0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grhl2Q8K5C0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grhl2Q8K5C0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grhl2Q8K5C0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grhl2Q8K5C0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grhl2Q8K5C0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grhl2Q8K5C0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grhl2Q8K5C0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grhl2Q8K5C0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grhl2Q8K5C0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grhl2Q8K5C0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grhl2Q8K5C0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grhl2Q8K5C0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grhl2Q8K5C0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Grhl2Q8K5C0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grhl2Q8K5C0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grhl2Q8K5C0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grhl2Q8K5C0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Grhl2Q8K5C0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Grhl2Q8K5C0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grhl2Q8K5C0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Grhl2Q8K5C0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Grhl2Q8K5C0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Grhl2Q8K5C0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Grhl2Q8K5C0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Grhl2Q8K5C0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grhl2Q8K5C0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grhl2Q8K5C0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grhl2Q8K5C0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grhl2Q8K5C0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grhl2Q8K5C0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grhl2Q8K5C0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grhl2Q8K5C0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grhl2Q8K5C0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grhl2Q8K5C0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grhl2Q8K5C0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grhl2Q8K5C0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grhl2Q8K5C0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grhl2Q8K5C0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grhl2Q8K5C0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grhl2Q8K5C0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grhl2Q8K5C0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grhl2Q8K5C0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grhl2Q8K5C0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grhl2Q8K5C0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms