Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms