Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4G1

Ltbp4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp4Q8K4G1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ltbp4Q8K4G1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ltbp4Q8K4G1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ltbp4Q8K4G1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ltbp4Q8K4G1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ltbp4Q8K4G1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ltbp4Q8K4G1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ltbp4Q8K4G1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Ltbp4Q8K4G1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ltbp4Q8K4G1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ltbp4Q8K4G1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ltbp4Q8K4G1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ltbp4Q8K4G1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ltbp4Q8K4G1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ltbp4Q8K4G1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ltbp4Q8K4G1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ltbp4Q8K4G1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ltbp4Q8K4G1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Ltbp4Q8K4G1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ltbp4Q8K4G1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ltbp4Q8K4G1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ltbp4Q8K4G1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ltbp4Q8K4G1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ltbp4Q8K4G1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ltbp4Q8K4G1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ltbp4Q8K4G1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ltbp4Q8K4G1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ltbp4Q8K4G1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Ltbp4Q8K4G1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Ltbp4Q8K4G1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ltbp4Q8K4G1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ltbp4Q8K4G1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ltbp4Q8K4G1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ltbp4Q8K4G1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ltbp4Q8K4G1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Ltbp4Q8K4G1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Ltbp4Q8K4G1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Ltbp4Q8K4G1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ltbp4Q8K4G1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ltbp4Q8K4G1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ltbp4Q8K4G1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ltbp4Q8K4G1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ltbp4Q8K4G1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ltbp4Q8K4G1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ltbp4Q8K4G1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ltbp4Q8K4G1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ltbp4Q8K4G1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ltbp4Q8K4G1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ltbp4Q8K4G1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ltbp4Q8K4G1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Ltbp4Q8K4G1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ltbp4Q8K4G1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ltbp4Q8K4G1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ltbp4Q8K4G1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ltbp4Q8K4G1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ltbp4Q8K4G1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ltbp4Q8K4G1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ltbp4Q8K4G1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Ltbp4Q8K4G1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ltbp4Q8K4G1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ltbp4Q8K4G1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ltbp4Q8K4G1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ltbp4Q8K4G1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ltbp4Q8K4G1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ltbp4Q8K4G1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Ltbp4Q8K4G1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ltbp4Q8K4G1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ltbp4Q8K4G1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ltbp4Q8K4G1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ltbp4Q8K4G1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ltbp4Q8K4G1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ltbp4Q8K4G1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ltbp4Q8K4G1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ltbp4Q8K4G1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ltbp4Q8K4G1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Ltbp4Q8K4G1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ltbp4Q8K4G1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ltbp4Q8K4G1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ltbp4Q8K4G1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ltbp4Q8K4G1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ltbp4Q8K4G1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ltbp4Q8K4G1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ltbp4Q8K4G1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ltbp4Q8K4G1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ltbp4Q8K4G1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ltbp4Q8K4G1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ltbp4Q8K4G1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ltbp4Q8K4G1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ltbp4Q8K4G1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ltbp4Q8K4G1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ltbp4Q8K4G1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ltbp4Q8K4G1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ltbp4Q8K4G1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ltbp4Q8K4G1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ltbp4Q8K4G1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Ltbp4Q8K4G1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ltbp4Q8K4G1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ltbp4Q8K4G1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ltbp4Q8K4G1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ltbp4Q8K4G1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms