Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3J1

Ndufs8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs8Q8K3J1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndufs8Q8K3J1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.3 ms