Protein–RNA interactions for Protein: Q8K327

Champ1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Champ1Q8K327 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Champ1Q8K327 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Champ1Q8K327 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Champ1Q8K327 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Champ1Q8K327 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Champ1Q8K327 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Champ1Q8K327 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Champ1Q8K327 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Champ1Q8K327 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Champ1Q8K327 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Champ1Q8K327 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Champ1Q8K327 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Champ1Q8K327 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Champ1Q8K327 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Champ1Q8K327 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Champ1Q8K327 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Champ1Q8K327 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Champ1Q8K327 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Champ1Q8K327 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Champ1Q8K327 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Champ1Q8K327 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Champ1Q8K327 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Champ1Q8K327 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Champ1Q8K327 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Champ1Q8K327 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Champ1Q8K327 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Champ1Q8K327 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Champ1Q8K327 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Champ1Q8K327 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Champ1Q8K327 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Champ1Q8K327 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Champ1Q8K327 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Champ1Q8K327 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Champ1Q8K327 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Champ1Q8K327 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Champ1Q8K327 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Champ1Q8K327 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Champ1Q8K327 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Champ1Q8K327 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Champ1Q8K327 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Champ1Q8K327 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Champ1Q8K327 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Champ1Q8K327 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Champ1Q8K327 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Champ1Q8K327 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Champ1Q8K327 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Champ1Q8K327 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Champ1Q8K327 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Champ1Q8K327 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Champ1Q8K327 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Champ1Q8K327 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Champ1Q8K327 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Champ1Q8K327 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Champ1Q8K327 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Champ1Q8K327 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Champ1Q8K327 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Champ1Q8K327 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Champ1Q8K327 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Champ1Q8K327 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Champ1Q8K327 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Champ1Q8K327 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Champ1Q8K327 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Champ1Q8K327 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Champ1Q8K327 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Champ1Q8K327 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Champ1Q8K327 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Champ1Q8K327 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Champ1Q8K327 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Champ1Q8K327 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Champ1Q8K327 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Champ1Q8K327 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Champ1Q8K327 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Champ1Q8K327 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Champ1Q8K327 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Champ1Q8K327 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Champ1Q8K327 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Champ1Q8K327 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Champ1Q8K327 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Champ1Q8K327 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Champ1Q8K327 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Champ1Q8K327 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Champ1Q8K327 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Champ1Q8K327 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Champ1Q8K327 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Champ1Q8K327 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Champ1Q8K327 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Champ1Q8K327 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Champ1Q8K327 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Champ1Q8K327 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Champ1Q8K327 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Champ1Q8K327 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Champ1Q8K327 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Champ1Q8K327 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Champ1Q8K327 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Champ1Q8K327 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Champ1Q8K327 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Champ1Q8K327 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Champ1Q8K327 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Champ1Q8K327 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Champ1Q8K327 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms