Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ncapd2Q8K2Z4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ncapd2Q8K2Z4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ncapd2Q8K2Z4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ncapd2Q8K2Z4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ncapd2Q8K2Z4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ncapd2Q8K2Z4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ncapd2Q8K2Z4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ncapd2Q8K2Z4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ncapd2Q8K2Z4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ncapd2Q8K2Z4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ncapd2Q8K2Z4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ncapd2Q8K2Z4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ncapd2Q8K2Z4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ncapd2Q8K2Z4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ncapd2Q8K2Z4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Ncapd2Q8K2Z4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Ncapd2Q8K2Z4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ncapd2Q8K2Z4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ncapd2Q8K2Z4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ncapd2Q8K2Z4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ncapd2Q8K2Z4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ncapd2Q8K2Z4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ncapd2Q8K2Z4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ncapd2Q8K2Z4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ncapd2Q8K2Z4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ncapd2Q8K2Z4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ncapd2Q8K2Z4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ncapd2Q8K2Z4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ncapd2Q8K2Z4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ncapd2Q8K2Z4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ncapd2Q8K2Z4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ncapd2Q8K2Z4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ncapd2Q8K2Z4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ncapd2Q8K2Z4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ncapd2Q8K2Z4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ncapd2Q8K2Z4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ncapd2Q8K2Z4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ncapd2Q8K2Z4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ncapd2Q8K2Z4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ncapd2Q8K2Z4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ncapd2Q8K2Z4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ncapd2Q8K2Z4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ncapd2Q8K2Z4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ncapd2Q8K2Z4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ncapd2Q8K2Z4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ncapd2Q8K2Z4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ncapd2Q8K2Z4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ncapd2Q8K2Z4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ncapd2Q8K2Z4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ncapd2Q8K2Z4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ncapd2Q8K2Z4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ncapd2Q8K2Z4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ncapd2Q8K2Z4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ncapd2Q8K2Z4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ncapd2Q8K2Z4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ncapd2Q8K2Z4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ncapd2Q8K2Z4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ncapd2Q8K2Z4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ncapd2Q8K2Z4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ncapd2Q8K2Z4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ncapd2Q8K2Z4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ncapd2Q8K2Z4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ncapd2Q8K2Z4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ncapd2Q8K2Z4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ncapd2Q8K2Z4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ncapd2Q8K2Z4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ncapd2Q8K2Z4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ncapd2Q8K2Z4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ncapd2Q8K2Z4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ncapd2Q8K2Z4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ncapd2Q8K2Z4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ncapd2Q8K2Z4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ncapd2Q8K2Z4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ncapd2Q8K2Z4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ncapd2Q8K2Z4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ncapd2Q8K2Z4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ncapd2Q8K2Z4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ncapd2Q8K2Z4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms