Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0Y2

Krt33a, Keratin, type I cuticular Ha3-I, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33aQ8K0Y2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt33aQ8K0Y2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt33aQ8K0Y2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms