Protein–RNA interactions for Protein: Q8CII8

Syne4, Nesprin-4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4Q8CII8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syne4Q8CII8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syne4Q8CII8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syne4Q8CII8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syne4Q8CII8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syne4Q8CII8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syne4Q8CII8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syne4Q8CII8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syne4Q8CII8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Syne4Q8CII8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syne4Q8CII8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syne4Q8CII8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Syne4Q8CII8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syne4Q8CII8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syne4Q8CII8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syne4Q8CII8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syne4Q8CII8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Syne4Q8CII8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syne4Q8CII8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syne4Q8CII8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Syne4Q8CII8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syne4Q8CII8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syne4Q8CII8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syne4Q8CII8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syne4Q8CII8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syne4Q8CII8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syne4Q8CII8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syne4Q8CII8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syne4Q8CII8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syne4Q8CII8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syne4Q8CII8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syne4Q8CII8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syne4Q8CII8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Syne4Q8CII8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syne4Q8CII8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syne4Q8CII8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syne4Q8CII8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syne4Q8CII8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syne4Q8CII8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syne4Q8CII8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syne4Q8CII8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syne4Q8CII8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syne4Q8CII8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Syne4Q8CII8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syne4Q8CII8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Syne4Q8CII8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syne4Q8CII8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syne4Q8CII8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syne4Q8CII8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syne4Q8CII8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syne4Q8CII8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syne4Q8CII8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syne4Q8CII8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syne4Q8CII8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syne4Q8CII8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syne4Q8CII8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syne4Q8CII8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syne4Q8CII8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syne4Q8CII8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syne4Q8CII8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syne4Q8CII8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syne4Q8CII8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syne4Q8CII8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syne4Q8CII8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syne4Q8CII8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syne4Q8CII8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syne4Q8CII8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syne4Q8CII8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syne4Q8CII8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Syne4Q8CII8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Syne4Q8CII8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Syne4Q8CII8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Syne4Q8CII8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syne4Q8CII8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syne4Q8CII8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syne4Q8CII8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syne4Q8CII8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syne4Q8CII8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Syne4Q8CII8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syne4Q8CII8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Syne4Q8CII8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syne4Q8CII8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syne4Q8CII8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syne4Q8CII8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syne4Q8CII8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syne4Q8CII8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syne4Q8CII8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syne4Q8CII8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syne4Q8CII8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syne4Q8CII8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syne4Q8CII8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syne4Q8CII8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syne4Q8CII8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syne4Q8CII8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syne4Q8CII8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syne4Q8CII8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syne4Q8CII8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syne4Q8CII8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Syne4Q8CII8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Syne4Q8CII8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms