Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT1

Ngef, Ephexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgefQ8CHT1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NgefQ8CHT1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NgefQ8CHT1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NgefQ8CHT1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NgefQ8CHT1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NgefQ8CHT1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NgefQ8CHT1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NgefQ8CHT1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NgefQ8CHT1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NgefQ8CHT1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NgefQ8CHT1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NgefQ8CHT1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NgefQ8CHT1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NgefQ8CHT1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NgefQ8CHT1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NgefQ8CHT1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NgefQ8CHT1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NgefQ8CHT1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NgefQ8CHT1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NgefQ8CHT1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NgefQ8CHT1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NgefQ8CHT1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NgefQ8CHT1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NgefQ8CHT1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NgefQ8CHT1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NgefQ8CHT1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NgefQ8CHT1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NgefQ8CHT1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NgefQ8CHT1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NgefQ8CHT1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NgefQ8CHT1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NgefQ8CHT1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NgefQ8CHT1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NgefQ8CHT1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NgefQ8CHT1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NgefQ8CHT1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NgefQ8CHT1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NgefQ8CHT1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NgefQ8CHT1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NgefQ8CHT1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NgefQ8CHT1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NgefQ8CHT1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NgefQ8CHT1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NgefQ8CHT1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NgefQ8CHT1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NgefQ8CHT1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NgefQ8CHT1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NgefQ8CHT1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NgefQ8CHT1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NgefQ8CHT1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NgefQ8CHT1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NgefQ8CHT1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NgefQ8CHT1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NgefQ8CHT1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NgefQ8CHT1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NgefQ8CHT1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NgefQ8CHT1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NgefQ8CHT1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NgefQ8CHT1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NgefQ8CHT1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NgefQ8CHT1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NgefQ8CHT1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NgefQ8CHT1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NgefQ8CHT1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NgefQ8CHT1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NgefQ8CHT1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NgefQ8CHT1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NgefQ8CHT1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NgefQ8CHT1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NgefQ8CHT1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NgefQ8CHT1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NgefQ8CHT1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NgefQ8CHT1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NgefQ8CHT1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NgefQ8CHT1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NgefQ8CHT1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NgefQ8CHT1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NgefQ8CHT1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NgefQ8CHT1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NgefQ8CHT1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NgefQ8CHT1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms