Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT0

Aldh4a1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh4a1Q8CHT0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh4a1Q8CHT0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Aldh4a1Q8CHT0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Aldh4a1Q8CHT0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Aldh4a1Q8CHT0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh4a1Q8CHT0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh4a1Q8CHT0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh4a1Q8CHT0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh4a1Q8CHT0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh4a1Q8CHT0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh4a1Q8CHT0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh4a1Q8CHT0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh4a1Q8CHT0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh4a1Q8CHT0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh4a1Q8CHT0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Aldh4a1Q8CHT0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Aldh4a1Q8CHT0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aldh4a1Q8CHT0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aldh4a1Q8CHT0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aldh4a1Q8CHT0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aldh4a1Q8CHT0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Aldh4a1Q8CHT0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aldh4a1Q8CHT0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aldh4a1Q8CHT0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aldh4a1Q8CHT0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aldh4a1Q8CHT0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aldh4a1Q8CHT0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh4a1Q8CHT0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh4a1Q8CHT0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh4a1Q8CHT0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh4a1Q8CHT0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh4a1Q8CHT0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aldh4a1Q8CHT0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aldh4a1Q8CHT0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aldh4a1Q8CHT0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Aldh4a1Q8CHT0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aldh4a1Q8CHT0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aldh4a1Q8CHT0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Aldh4a1Q8CHT0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aldh4a1Q8CHT0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Aldh4a1Q8CHT0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Aldh4a1Q8CHT0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Aldh4a1Q8CHT0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aldh4a1Q8CHT0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aldh4a1Q8CHT0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aldh4a1Q8CHT0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aldh4a1Q8CHT0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aldh4a1Q8CHT0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aldh4a1Q8CHT0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aldh4a1Q8CHT0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aldh4a1Q8CHT0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aldh4a1Q8CHT0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aldh4a1Q8CHT0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aldh4a1Q8CHT0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aldh4a1Q8CHT0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aldh4a1Q8CHT0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aldh4a1Q8CHT0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms