Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHH9

Sept8, Septin-8, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept8Q8CHH9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sept8Q8CHH9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sept8Q8CHH9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sept8Q8CHH9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sept8Q8CHH9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sept8Q8CHH9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sept8Q8CHH9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sept8Q8CHH9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sept8Q8CHH9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sept8Q8CHH9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sept8Q8CHH9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sept8Q8CHH9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sept8Q8CHH9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sept8Q8CHH9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sept8Q8CHH9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sept8Q8CHH9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sept8Q8CHH9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sept8Q8CHH9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sept8Q8CHH9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sept8Q8CHH9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sept8Q8CHH9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sept8Q8CHH9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sept8Q8CHH9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sept8Q8CHH9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sept8Q8CHH9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sept8Q8CHH9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sept8Q8CHH9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sept8Q8CHH9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sept8Q8CHH9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sept8Q8CHH9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sept8Q8CHH9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sept8Q8CHH9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sept8Q8CHH9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sept8Q8CHH9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sept8Q8CHH9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sept8Q8CHH9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sept8Q8CHH9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sept8Q8CHH9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sept8Q8CHH9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sept8Q8CHH9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sept8Q8CHH9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sept8Q8CHH9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sept8Q8CHH9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sept8Q8CHH9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sept8Q8CHH9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sept8Q8CHH9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sept8Q8CHH9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sept8Q8CHH9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sept8Q8CHH9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sept8Q8CHH9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sept8Q8CHH9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sept8Q8CHH9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sept8Q8CHH9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sept8Q8CHH9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sept8Q8CHH9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sept8Q8CHH9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms