Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Upp2Q8CGR7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Upp2Q8CGR7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms