Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGM2

Rp1l1, Retinitis pigmentosa 1-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1l1Q8CGM2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rp1l1Q8CGM2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rp1l1Q8CGM2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms