Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC4

Lsm14b, Protein LSM14 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm14bQ8CGC4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lsm14bQ8CGC4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lsm14bQ8CGC4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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