Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpc3Q8CFZ4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpc3Q8CFZ4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpc3Q8CFZ4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpc3Q8CFZ4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpc3Q8CFZ4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpc3Q8CFZ4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpc3Q8CFZ4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpc3Q8CFZ4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpc3Q8CFZ4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpc3Q8CFZ4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpc3Q8CFZ4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpc3Q8CFZ4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpc3Q8CFZ4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpc3Q8CFZ4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpc3Q8CFZ4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpc3Q8CFZ4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpc3Q8CFZ4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpc3Q8CFZ4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpc3Q8CFZ4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpc3Q8CFZ4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpc3Q8CFZ4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpc3Q8CFZ4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpc3Q8CFZ4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpc3Q8CFZ4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpc3Q8CFZ4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpc3Q8CFZ4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpc3Q8CFZ4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpc3Q8CFZ4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpc3Q8CFZ4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpc3Q8CFZ4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpc3Q8CFZ4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpc3Q8CFZ4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpc3Q8CFZ4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpc3Q8CFZ4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpc3Q8CFZ4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpc3Q8CFZ4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpc3Q8CFZ4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpc3Q8CFZ4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpc3Q8CFZ4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpc3Q8CFZ4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.7 ms