Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc17Q8CE13 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc17Q8CE13 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms