Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc178Q8CDV0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc178Q8CDV0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc178Q8CDV0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc178Q8CDV0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc178Q8CDV0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc178Q8CDV0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc178Q8CDV0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc178Q8CDV0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc178Q8CDV0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc178Q8CDV0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc178Q8CDV0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc178Q8CDV0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc178Q8CDV0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc178Q8CDV0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc178Q8CDV0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc178Q8CDV0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc178Q8CDV0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc178Q8CDV0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc178Q8CDV0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc178Q8CDV0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc178Q8CDV0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc178Q8CDV0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc178Q8CDV0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc178Q8CDV0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc178Q8CDV0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc178Q8CDV0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc178Q8CDV0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc178Q8CDV0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc178Q8CDV0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc178Q8CDV0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc178Q8CDV0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc178Q8CDV0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc178Q8CDV0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc178Q8CDV0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc178Q8CDV0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc178Q8CDV0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc178Q8CDV0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc178Q8CDV0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc178Q8CDV0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc178Q8CDV0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc178Q8CDV0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc178Q8CDV0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc178Q8CDV0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc178Q8CDV0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc178Q8CDV0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms