Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDU4

Fbxl13, F-box/LRR-repeat protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxl13Q8CDU4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxl13Q8CDU4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxl13Q8CDU4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxl13Q8CDU4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxl13Q8CDU4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxl13Q8CDU4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxl13Q8CDU4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxl13Q8CDU4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxl13Q8CDU4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxl13Q8CDU4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Fbxl13Q8CDU4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Fbxl13Q8CDU4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Fbxl13Q8CDU4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxl13Q8CDU4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms